Từ năm 1950-1952, ông đảm nhiệm các chức vụ: Chính trị viên Tiểu đoàn, Chính trị viên Ban cung cấp Trung đoàn 64, rồi Phó chủ nhiệm chính trị Trung đoàn 64, Đại đoàn 320
Năm 1954, ông tham gia chiến dịch Điện Biên Phủ với cương vị là Trung đoàn bậc Phó, Cán bộ Phòng Cán bộ, Cục Tổ chức- Tổng cục Chính trị.
Sau chiến dịch Điện Biên Phủ, ông được giao nhiệm vụ sang Lào phụ trách giúp Lào về công tác tổ chức trong quân đội. Tháng 8-1954 ông là Chủ nhiệm Chính trị Đoàn 100[3][4][5]- Đoàn Cố vấn quân sự Việt nam tại Lào (Tư lệnh lúc đó là Chu Huy Mân).Đồng chí Lê Tiến Phục (thứ hai từ trái sang) tại buổi họp mặt của Quân ủy trung ương với đại biểu gia đình liệt sĩ, gia đình quân nhân, anh chị em thương binh ưu tú, ngày 25-08-1968
Từ năm 1956, ông lần lượt được giao giữ chức Chính ủy, Bí thư Đoàn Ủy Đoàn 40; Chủ nhiệm Chính trị Sư đoàn 469, Quyền bí thư Sư đoàn ủy; Chính ủy Lữ đoàn 374, Bí thư Lữ đoàn ủy, Đảng ủy viên Đại đoàn 351; Chủ nhiệm Chính trị, Đảng ủy viên Đoàn 959[6].
Từ tháng 7-1963, ông là Phó Cục trưởng Cục Tổ chức; Phó Cục trưởng Cục Cán bộ, Phó bí thư Ban chấp hành Đảng bộ cơ quan Tổng cục Chính trị. Tháng 11-1967 ông giữ chức vụ Cục trưởng Cục Chính sách, Bí thư Ban chấp hành Đảng bộ cơ quan Tổng cục Chính trị[7]
Tháng 11-1978, ông là Phó Chính ủy Binh đoàn 678 (Thượng tướng Trần Văn Quang lúc đó là Tư lệnh).
Tháng 4-1982, ông lại được điều về làm Cục trưởng Cục Chính sách[8][9] - Bộ Quốc phòng
Tháng 9-1985, do sức khỏe ông chuyển làm chuyên viên cho Cục trưởng.
Từ tháng 5-1988, ông nghỉ dưỡng bệnh
Năm 1958, ông Lê Tiến Phục được phong quân hàm Trung tá; năm 1960, thăng quân hàm Thượng tá; năm 1973, thăng quân hàm Đại tá; năm 1983 thăng quân hàm Thiếu tướng. Ông mất tại Hà Nội ngày 16-05-1999.
